RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ITGA4P13612 1032 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SEZ6Q53EL9 994 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.19■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KBTBD13C9JR72 458 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ATP5HO75947 161 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HAUS5O94927 633 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ARFIP2P53365 341 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ERVK-24P63145 666 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 INPP1P49441 399 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 IL18RAPO95256 599 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ICAM1P05362 532 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CYP2C9P11712 490 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GTF2H1P32780 548 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GRB10Q13322 594 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DRC3Q9H069 523 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CXorf38Q8TB03 319 aa22.18■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 AK9Q5TCS8 1911 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TRAPPC3O43617 180 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 IRF1P10914 325 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CETPP11597 493 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ST3GAL1Q11201 340 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DGKDQ16760 1214 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CAP2P40123 477 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRB2O60241 1585 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RSPH10BP0C881 870 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ACTR2P61160 394 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ARL8AQ96BM9 186 aa22.17■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DEPDC5O75140 1603 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MED15Q96RN5 788 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FUT8Q9BYC5 575 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 TBX20Q9UMR3 447 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MED24O75448 989 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 APRTP07741 180 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 COMTP21964 271 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 LONRF1Q17RB8 773 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DDIASQ8IXT1 998 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC6O75061 913 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 STILQ15468 1287 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 BTBD6Q96KE9 485 aa22.16■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RAD51CO43502 376 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HBP1O60381 514 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ZIM3Q96PE6 472 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ZFATQ9P243 1243 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CD4P01730 458 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 HUNKP57058 714 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 THEGQ9P2T0 379 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 MAFGO15525 162 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 CDR2Q01850 454 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.15■■□□□ 1.14
SMURF1-201ENST00000361125 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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