RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SLMAPQ14BN4 828 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SYT11Q9BT88 431 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 CYP24A1Q07973 514 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 MGRN1O60291 552 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 KRT16P08779 473 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 WNT7BP56706 349 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 DLK2Q6UY11 383 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 CEP120Q8N960 986 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 UBE4BO95155 1302 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ZWILCHQ9H900 591 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 PICK1Q9NRD5 415 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 C15orf41Q9Y2V0 281 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 CNTNAP1P78357 1384 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 LRRD1A4D1F6 860 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 WEE2P0C1S8 567 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 PTGER2P43116 358 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 KRT76Q01546 638 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 LIN9Q5TKA1 542 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 NHSQ6T4R5 1651 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 HSPA6P17066 643 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 HSD17B4P51659 736 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 SYNCQ9H7C4 482 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 FBXO40Q9UH90 709 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS2-201ENST00000329078 BANF1O75531 89 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 TCF4P15884 667 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R40P59535 323 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 TAF11Q15544 211 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 P3H1Q32P28 736 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RFX1P22670 979 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 PCK1P35558 622 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 KRT1P04264 644 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 GZMAP12544 262 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 JAK3P52333 1124 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ZNRF3Q9ULT6 936 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RARGP13631 454 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 CCND2P30279 289 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ALCAMQ13740 583 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 C4orf19Q8IY42 314 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF570Q96NI8 536 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RASA4BC9J798 803 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA8RI6L899 631 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 SGK1O00141 431 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 RASA4O43374 803 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB7AO95365 584 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ACTR2P61160 394 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF516Q92618 1163 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms