RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 UBR7Q8N806 425 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 PRELID2Q8N945 189 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 DPH5Q9H2P9 285 aa24.42■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.41■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 THAP12O43422 761 aa24.41■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 PHF2O75151 1096 aa24.41■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.41■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.41■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.41■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.4■■□□□ 1.5
SNX18-201ENST00000326277 VTA1Q9NP79 307 aa24.4■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 PPFIA1Q13136 1202 aa24.39■■□□□ 1.5
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SNX18-201ENST00000326277 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.39■■□□□ 1.49
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SNX18-201ENST00000326277 CDT1Q9H211 546 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
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SNX18-201ENST00000326277 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 TMEM192Q8IY95 271 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 PPTC7Q8NI37 304 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 LRRC45Q96CN5 670 aa24.38■■□□□ 1.49
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SNX18-201ENST00000326277 KATNBL1Q9H079 304 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 B4GALT4O60513 344 aa24.37■■□□□ 1.49
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SNX18-201ENST00000326277 ZNF286BP0CG31 522 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 PTP4A2Q12974 167 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 CD302Q8IX05 232 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 CISHQ9NSE2 258 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX18-201ENST00000326277 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.37■■□□□ 1.49
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