RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 IGFBP4P22692 258 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 MYLIPQ8WY64 445 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF516Q92618 1163 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 GUCD1Q96NT3 240 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 REV3LO60673 3130 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 I3L4J1 428 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 BRCC3P46736 316 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRE1Q14246 886 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PTPROQ16827 1216 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TMC7Q7Z402 723 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 BORCS6Q96GS4 357 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ANO9A1A5B4 782 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PIRO00625 290 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CA8P35219 290 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 AP3M2P53677 418 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ERVFC1P60507 584 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN10P78369 228 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 BIRC3Q13489 604 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK1Q14012 370 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TAS1R1Q7RTX1 841 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TCF25Q9BQ70 676 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 STK39Q9UEW8 545 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 IKBKBO14920 756 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC3O43617 180 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PHACTR2O75167 634 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 GNA14O95837 355 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 SOD2P04179 222 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 IRS1P35568 1242 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 B3GALT6Q96L58 329 aa24.1■■□□□ 1.45
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HOXD4-201ENST00000306324 EYSQ5T1H1 3165 aa24.1■■□□□ 1.45
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HOXD4-201ENST00000306324 ENPEPQ07075 957 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CEP57Q86XR8 500 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF560Q96MR9 790 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 ZBP1Q9H171 429 aa24.09■■□□□ 1.45
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HOXD4-201ENST00000306324 C2CD2LO14523 706 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 EFEMP2O95967 443 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 GCLMP48507 274 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TAF6P49848 677 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 PPP3CAQ08209 521 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 USP41Q3LFD5 358 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf38Q8TB03 319 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXD4-201ENST00000306324 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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HOXD4-201ENST00000306324 CTSAP10619 480 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 FOSL2P15408 326 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 PNPLA4P41247 253 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 GLUD2P49448 558 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 TRPC3Q13507 836 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SV2AQ7L0J3 742 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 THAP9Q9H5L6 903 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 SPTLC1O15269 473 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 STX10O60499 249 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CLSTN1O94985 981 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL14O95715 111 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXD4-201ENST00000306324 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
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