RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 EBF3Q9H4W6 596 aa22.5■■□□□ 1.19
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF653Q96CK0 615 aa22.47■■□□□ 1.19
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ODC1-201ENST00000234111 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
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ODC1-201ENST00000234111 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.46■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 TMCC1O94876 653 aa22.45■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.45■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 RAP1GDS1P52306 607 aa22.45■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 CDK16Q00536 496 aa22.45■■□□□ 1.19
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