RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	VAV3	Q9UKW4	847 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ITIH2	P19823	946 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ANXA13	P27216	316 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	DACT2	Q5SW24	774 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PPM1N	Q8N819	430 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM11	Q96F44	468 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SNED1	Q8TER0	1413 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	MAPK13	O15264	365 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ETS1	P14921	441 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ELF1	P32519	619 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	JAK3	P52333	1124 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	LMNB2	Q03252	620 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TNFAIP1	Q13829	316 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	MREG	Q8N565	214 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PAF1	Q8N7H5	531 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TMX2	Q9Y320	296 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ENTPD3	O75355	529 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	GH1	P01241	217 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF2H1	P32780	548 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	CPA2	P48052	419 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	JAG1	P78504	1218 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PRKCE	Q02156	737 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	FAXC	Q5TGI0	409 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SIX2	Q9NPC8	291 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	HAO1	Q9UJM8	370 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNJ2	P63252	427 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	DRP2	Q13474	957 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	DUPD1	Q68J44	220 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC27	Q6P3X3	843 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SEMA4D	Q92854	862 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	RFX1	P22670	979 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	RAD23B	P54727	409 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC20A2	Q08357	652 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	NCOA4	Q13772	614 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	HYI	Q5T013	277 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM237	Q96Q45	408 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MCF2L	O15068	1137 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP3A7	P24462	503 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	TNFRSF8	P28908	595 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CFAP157	Q5JU67	520 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CD302	Q8IX05	232 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	E2F8	A0AVK6	867 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	UGCG	Q16739	394 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	EMC1	Q8N766	993 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SPDL1	Q96EA4	605 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO40	Q9UH90	709 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	BANF1	O75531	89 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GGPS1	O95749	300 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DRD4	P21917	467 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF699	Q32M78	642 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF149	Q8NC42	400 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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