RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF461Q8TAF7 563 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL4Q96EI5 215 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 RTKNQ9BST9 563 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 POLD4Q9HCU8 107 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF37A1IGU5 675 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 EFNA5P52803 228 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 NRLP54845 237 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD1Q15327 319 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM78AQ5JUQ0 283 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ELMOD1Q8N336 334 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR27A2RRH5 827 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 FCARP24071 287 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 OSTNP61366 133 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD5Q13467 585 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4A22Q5TCH4 519 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5DC1Q5TFE4 455 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC8B1Q6J4K2 584 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEHQ6S545 545 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR23BQ6ZRT6 265 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF7Q92985 503 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRDQ9H2X0 955 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PARD6AQ9NPB6 346 aa30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 VWA8A3KMH1 1905 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PODXLO00592 558 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 GDI1P31150 447 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SPEM2Q0P670 501 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS36Q5K4E3 855 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM3CQ92520 227 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 NUB1Q9Y5A7 615 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 INSL5Q9Y5Q6 135 aa30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C4K7 107 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCEQ6IPM2 695 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP120Q8N960 986 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 LMAN1LQ9HAT1 526 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A7Q9NVC3 462 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 PIAS3Q9Y6X2 628 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA1BQ00975 2339 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SHISA7A6NL88 538 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ABLIM3O94929 683 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF2P15336 505 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 RPA1P27694 616 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR3P51677 355 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF568Q3ZCX4 644 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 ASB16Q96NS5 453 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ERI5 159 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC24AO95486 1093 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TGM1P22735 817 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM5P41594 1212 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR2P41597 374 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CTXN3Q4LDR2 81 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 LAIR1Q6GTX8 287 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL8Q8IYN2 117 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 KIFAP3Q92845 792 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SMARCD2Q92925 531 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF3C6Q969F1 213 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 IER2Q9BTL4 223 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF13BQ9Y275 285 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTBN2O15020 2390 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 EPG5Q9HCE0 2579 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTCH4Q99466 2003 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 LARGE1O95461 756 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52Z1P0C646 297 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL4P12829 197 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC3P17980 439 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS3Q68CZ6 603 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 VITQ6UXI7 678 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 HS6ST3Q8IZP7 471 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CDT1Q9H211 546 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL5Q9UKA1 691 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC169A6NNP5 214 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SYN3O14994 580 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 JAK2O60674 1132 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 VIPR2P41587 438 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ME3Q16798 604 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 BHMT2Q9H2M3 363 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRP12270 2363 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF263O14978 683 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 MICAL2O94851 1124 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 HARSP12081 509 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TDGF1P13385 188 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA1P17302 382 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 TWF1Q12792 350 aa29.98■■■□□ 2.39
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