RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AURKCQ9UQB9 309 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SCP2P22307 547 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IL12RB1P42701 662 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RBBP8Q99708 897 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LZTS1Q9Y250 596 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RFFLQ8WZ73 363 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GPR141Q7Z602 305 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KRT35Q92764 455 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM210AQ96ND0 272 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CATSPER2Q96P56 530 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STX11O75558 287 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MFN2O95140 757 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RBBP7Q16576 425 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PGM3O95394 542 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TNFAIP2Q03169 654 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TCP10Q12799 353 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ITGADQ13349 1161 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLFN13Q68D06 897 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf22Q6V702 233 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HES6Q96HZ4 224 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CITO14578 2027 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PHF2O75151 1096 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MSH3P20585 1137 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SKP1P63208 163 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 BBS2Q9BXC9 721 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM66O15016 1216 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CLIC2O15247 247 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL41O60662 606 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ALBP02768 609 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PSAPP07602 524 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDYLQ9Y232 598 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CYP21A2P08686 494 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RRM2P31350 389 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ADD2P35612 726 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 JAK3P52333 1124 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9A5Q14940 896 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 C2CD6Q53TS8 623 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ATL2Q8NHH9 583 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NSL1Q96IY1 281 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 FAM170AA1A519 330 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 COX10Q12887 443 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 MTA1Q13330 715 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NEK5Q6P3R8 708 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms