RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.09■□□□□ 0.97
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SGMS1-208ENST00000608287 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.09■□□□□ 0.97
SGMS1-208ENST00000608287 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
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SGMS1-208ENST00000608287 RTL10Q7L3V2 364 aa21.08■□□□□ 0.97
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SGMS1-208ENST00000608287 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
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SGMS1-208ENST00000608287 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
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SGMS1-208ENST00000608287 N4BP3O15049 544 aa21.04■□□□□ 0.96
SGMS1-208ENST00000608287 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC39A14Q15043 492 aa21.04■□□□□ 0.96
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