RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TSC2	P49815	1807 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NCAN	O14594	1321 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PODXL	O00592	558 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ABLIM3	O94929	683 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC24A	O95486	1093 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MUT	P22033	750 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX3	P56589	373 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK7	Q13164	816 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FZD5	Q13467	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	GRM2	Q14416	872 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	RTL10	Q7L3V2	364 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ANK1	P16157	1881 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338		E9PMD0	336 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ERI5	159 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTLC1	O15269	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	HIP1R	O75146	1068 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	LRG1	P02750	347 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PROZ	P22891	400 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ARPP19	P56211	112 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NELL1	Q92832	810 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRG1	O14668	218 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MOSPD3	O75425	235 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC24B	O95487	1268 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF2	P15336	505 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNE1	P15382	129 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN2	P17706	415 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MTAP	Q13126	283 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17A	Q16552	155 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	SYN3	O14994	580 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRB5	O75023	590 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MCF2	P10911	925 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	TDGF1	P13385	188 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC25A	P30304	524 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA9	P43362	315 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-233	ENST00000602338	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32

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