RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NXPE3Q969Y0 559 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM143Q96AN5 459 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NLRP4Q96MN2 994 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MYADMQ96S97 322 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 BCO2Q9BYV7 579 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PANK2Q9BZ23 570 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GINS2Q9Y248 185 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM150BA6NC51 233 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SHISA7A6NL88 538 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC169A6NNP5 214 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HIP1RO75146 1068 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RPS6KA5O75582 802 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 VTNP04004 478 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CAPNS1P04632 268 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FGFR1P11362 822 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SKIP12755 728 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PLS3P13797 630 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 IDEP14735 1019 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 AXLP30530 894 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PPM1AP35813 382 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ARL2P36404 184 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MAGEA9P43362 315 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 GPC3P51654 580 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ASIC1P78348 528 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 E2F4Q16254 413 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MAPK6Q16659 721 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KIZQ2M2Z5 673 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KCNK18Q7Z418 384 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HACE1Q8IYU2 909 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MYCT1Q8N699 235 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RNF149Q8NC42 400 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DDX12PQ92771 950 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 HVCN1Q96D96 273 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC51Q96ER9 411 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CASD1Q96PB1 797 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CEP89Q96ST8 783 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZBP1Q9H171 429 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RGS18Q9NS28 235 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC1Q9NV70 894 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DACT1Q9NYF0 836 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 NUP205Q92621 2012 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 TCHHQ07283 1943 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 MGAQ8IWI9 3026 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ARID2Q68CP9 1835 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB39O15060 712 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SPINK2P20155 84 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R2P41236 205 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PEX3P56589 373 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FAM189BP81408 668 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 PSMD2Q13200 908 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 POSTNQ15063 836 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 IL31Q6EBC2 164 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 UNC13DQ70J99 1090 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 DYMQ7RTS9 669 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-208ENST00000597576 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms