RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF4AO95239 1232 aa35.87■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMD6Q15008 389 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXR2Q6PJQ5 311 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 NELFBQ8WX92 580 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PODXLO00592 558 aa35.86■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GAT3O94766 335 aa35.86■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TLR9Q9NR96 1032 aa35.86■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTNND2Q9UQB3 1225 aa35.86■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TADA2AO75478 443 aa35.85■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 NLRP12P59046 1061 aa35.85■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP3O75969 853 aa35.84■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFBP4P22692 258 aa35.84■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR49Q8IV35 697 aa35.84■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTCH2Q9Y6C9 303 aa35.84■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TTI2Q6NXR4 508 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT10Q6P4F1 479 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 C3orf58Q8NDZ4 430 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 HASPINQ8TF76 798 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC127Q96BQ5 260 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 VN1R3Q9BXE9 311 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 DPP3Q9NY33 737 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa35.83■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS52Q8N1B4 723 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEF2KMTQ96G04 330 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 INTS13Q9NVM9 706 aa35.83■■■■□ 3.33
CTDNEP1-209ENST00000574205 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.331e-8■■■■■ 60.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa35.82■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM130Q8N3G9 435 aa35.81■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR12Q9C0I1 747 aa35.81■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 USP37Q86T82 979 aa35.8■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STX17P56962 302 aa35.79■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMC2Q8TDI7 906 aa35.79■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN10P78369 228 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf127Q8N9H9 656 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5B17Q8NGF7 314 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHO2Q8TD55 490 aa35.78■■■■□ 3.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa35.78■■■■□ 3.32
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