RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563155.1

PARN-208, Transcript of poly(A)-specific ribonuclease, human

TSL 2

Gene PARN, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARN-208	ENST00000563155	AK2	P54819	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	BPIFB4	P59827	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ADAM8	P78325	824 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	DUSP2	Q05923	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	DPT	Q07507	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MTM1	Q13496	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MORC3	Q14149	939 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	VPS72	Q15906	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MYOC	Q99972	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	USP19	O94966	1318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MGEA5	O60502	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	AHSG	P02765	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SBK3	P0C264	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MYF5	P13349	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CRHR1	P34998	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TM4SF4	P48230	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ADCY7	P51828	1080 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	WNT3A	P56704	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	GPSM2	P81274	684 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	FGL2	Q14314	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RAB39A	Q14964	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	KRT40	Q6A162	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MYD88	Q99836	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	F2RL2	O00254	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CD1A	P06126	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	GYPE	P15421	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	NPR1	P16066	1061 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	MCM7	P33993	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	HGFAC	Q04756	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	EDA	Q92838	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PTPN18	Q99952	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155		A0A1W2PPL8	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	TBX3	O15119	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	NCK2	O43639	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	STC2	O76061	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	RAP2A	P10114	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PRDX5	P30044	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	SLC7A1	P30825	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	PHKA1	P46020	1223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	CTXN1	P60606	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PARN-208	ENST00000563155	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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