RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 GCLMP48507 274 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 NFIL3Q16649 462 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 KYAT1Q16773 422 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BORCS6Q96GS4 357 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 DACH1Q9UI36 760 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ITGB3P05106 788 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 KRT19P08727 400 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 VAMP7P51809 220 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PPP3CAQ08209 521 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BFSP1Q12934 665 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ASB7Q9H672 318 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FANCLQ9NW38 375 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 DPP3Q9NY33 737 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PODXLO00592 558 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 B3GAT3O94766 335 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 IL18RAPO95256 599 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 DNAJB1P25685 340 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BMPR1AP36894 532 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BRCC3P46736 316 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CDR1P51861 262 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF558Q96NG5 402 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 GRIN2CQ14957 1233 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 UPP1Q16831 310 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SPATA1Q5VX52 437 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 LUZP1Q86V48 1076 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CGRRF1Q99675 332 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 INTS13Q9NVM9 706 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SIX4Q9UIU6 781 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FGF18O76093 207 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ALDH2P05091 517 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF165P49910 485 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 MYBPC2Q14324 1141 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SPTLC1O15269 473 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 GRM6O15303 877 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 LAG3P18627 525 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 NCAPHQ15003 741 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BEST2Q8NFU1 509 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 C2CD2Q9Y426 696 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CLSTN1O94985 981 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 KRT13P13646 458 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ERVK-21P61565 698 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 BIRC3Q13489 604 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CBWD6Q4V339 395 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 RNF214Q8ND24 703 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CXorf38Q8TB03 319 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 IGSF21Q96ID5 467 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CEP63Q96MT8 703 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 WDR49Q8IV35 697 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CD302Q8IX05 232 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 CBX8Q9HC52 389 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 C2CD2LO14523 706 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ATP1A3P13637 1013 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SV2AQ7L0J3 742 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 SLC35C1Q96A29 364 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
MEIS3-212ENST00000561293 TADA2AO75478 443 aa22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms