RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LCHNA4D1U4 455 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNNC2P02585 160 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSC1Q08554 894 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TUSC3Q13454 348 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBWD6Q4V339 395 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MIIPQ5JXC2 388 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SV2AQ7L0J3 742 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 BEST2Q8NFU1 509 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 RABGGTAQ92696 567 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 VPS16Q9H269 839 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CWH43Q9H720 699 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPP3Q9NY33 737 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYOGP15173 224 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP3A5P20815 502 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 FMO5P49326 533 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZACNQ401N2 412 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIX4Q9UIU6 781 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCN1AP35498 2009 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPEF2O14830 753 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 STX10O60499 249 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGB3P05106 788 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 GTF2H1P32780 548 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MXI1P50539 228 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 AP3M2P53677 418 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 BIRC3Q13489 604 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 VWA3BQ502W6 1294 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXorf38Q8TB03 319 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDST4Q9H3R1 872 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 VNN1O95497 513 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRPAP1P30533 357 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PBX3P40426 434 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLCNKBP51801 687 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 FANCCQ00597 558 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT39Q6A163 491 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 FIBCD1Q8N539 461 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO9A1A5B4 782 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 F8W810 466 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHACTR2O75167 634 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRN2O75325 713 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF15O94989 841 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT19P08727 400 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PBX2P40425 430 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR1G1P47890 313 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC11A1P49279 550 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PODXLO00592 558 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRP1O14786 923 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 SERPINC1P01008 464 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 HLA-DRAP01903 254 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 GALTP07902 379 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC00271P0C7V0 271 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCAR1P56945 870 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYL7Q01449 175 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPP1Q16831 310 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PBX4Q9BYU1 374 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIRO00625 290 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALDH2P05091 517 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-203ENST00000559737 CA3P07451 260 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms