RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PHKB	Q93100	1093 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYD88	Q99836	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		A0A1W2PRX2	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NRP1	O14786	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CDC14B	O60729	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC6A4	P31645	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAP2B	P61225	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FMO1	Q01740	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MORC3	Q14149	939 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CSRP2	Q16527	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GJA10	Q969M2	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61	3e-7	■■■□□ 19.2
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184		F8W8V4	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MYO1F	O00160	1098 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TBX3	O15119	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP5J	P18859	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CR2	P20023	1033 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HTR3A	P46098	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FLT3LG	P49771	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NOMO3	P69849	1222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CREM	Q03060	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNGA2	Q16280	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LMF1	Q96S06	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NCK2	O43639	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MATN4	O95460	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLAT	P00750	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BRAF	P15056	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TM4SF4	P48230	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SOX8	P57073	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	VPS72	Q15906	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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