RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EBAG9O00559 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GNB5O14775 395 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PDPK1O15530 556 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 BUB1O43683 1085 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 TOM1O60784 492 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PALMO75781 387 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CPP00450 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MYBP10242 640 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 RAG1P15918 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GAP43P17677 238 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KLRC1P26715 233 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 RPA1P27694 616 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CIITAP33076 1130 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SHMT1P34896 483 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC7A5Q01650 507 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 RING1Q06587 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CUL1Q13616 776 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CLUL1Q15846 466 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NFIL3Q16649 462 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 UBE2SQ16763 222 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PPM1JQ5JR12 505 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KCT2Q8NC54 265 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM13CQ8NE31 585 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SCFD2Q8WU76 684 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 LRRC45Q96CN5 670 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ATG4CQ96DT6 458 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PLVAPQ9BX97 442 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ANO3Q9BYT9 981 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GGA2Q9UJY4 613 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 SBF2Q86WG5 1849 aa6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MYH10P35580 1976 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 A0A087X0T9 212 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ANKRD62A6NC57 917 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 E9PMD0 336 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC188H7C350 402 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 TNFRSF10CO14798 259 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NCK2O43639 380 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ZEB2O60315 1214 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FLOT1O75955 427 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GLI1P08151 1106 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CYP3A4P08684 503 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CCDC172P0C7W6 258 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM228BP0C875 321 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ADH5P11766 374 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ELNP15502 786 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 FERP16591 822 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 MUTP22033 750 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 NR2F2P24468 414 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 CXCR5P32302 372 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GNGT1P63211 74 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GUCY2DQ02846 1103 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 GIT2Q14161 759 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.49□□□□□ -1.37
CHMP4A-210ENST00000552620 ARSHQ5FYA8 562 aa6.49□□□□□ -1.37
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