RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	ADD2	P35612	726 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	EPHB4	P54760	987 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF445	P59923	1031 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	C12orf40	Q86WS4	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TBATA	Q96M53	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MMP19	Q99542	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MROH8	Q9H579	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MYH7	P12883	1935 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	VWA5A	O00534	786 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	AP1G1	O43747	822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	KCNH1	O95259	989 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CAPNS1	P04632	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ASGR2	P07307	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RARB	P10826	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	HSD3B1	P14060	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ATP5J	P18859	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MAOB	P27338	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SERPINB3	P29508	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RENBP	P51606	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GFRA1	P56159	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ERVK-21	P61565	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	DSG1	Q02413	1049 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TLE2	Q04725	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SNX17	Q15036	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ELF2	Q15723	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CLUL1	Q15846	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	HYI	Q5T013	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MIER2	Q8N344	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TTC9	Q92623	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SNX21	Q969T3	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SBF2-208	ENST00000528478	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms