RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528414.5

PTPN22-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,424 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-207ENST00000528414 TBX18O95935 607 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPN22-207ENST00000528414 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 ASB3Q9Y575 518 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 COL4A3Q01955 1670 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 E7EVH7 732 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 PIAS2O75928 621 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 EGFRP00533 1210 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 CCDC192P0DO97 292 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPN22-207ENST00000528414 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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