RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 UBE4BO95155 1302 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 B3GAT3O94766 335 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 GARTP22102 1010 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 GLUD2P49448 558 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ACOT2P49753 483 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 NAB2Q15742 525 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 CD302Q8IX05 232 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 HASPINQ8TF76 798 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SUSD6Q92537 303 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TTC26A0AVF1 554 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 LACTBL1A8MY62 500 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 F8W810 466 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 C2CD2LO14523 706 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF4AO95239 1232 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 CLCNKBP51801 687 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 PSMD2Q13200 908 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 USP41Q3LFD5 358 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 IRAK3Q9Y616 596 aa16.78■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 PODXLO00592 558 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAPPC3O43617 180 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 KLRC4O43908 158 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM189A1O60320 539 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ADSSP30520 456 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SPAG1Q07617 926 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 EHHADHQ08426 723 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPN14Q15678 1187 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SAAL1Q96ER3 474 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 GPR62Q9BZJ7 368 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 S1PR5Q9H228 398 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ASB7Q9H672 318 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.77■□□□□ 0.28
TSNARE1-206ENST00000520462 TECTAO75443 2155 aa16.77■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 IL18RAPO95256 599 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PRR29P0C7W0 189 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KLRC2P26717 231 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNC3Q14003 757 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 UPP1Q16831 310 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PPFIBP1Q86W92 1011 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP57Q86XR8 500 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 BEST2Q8NFU1 509 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CASP10Q92851 521 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CDH22Q9UJ99 828 aa16.76■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 VWA8A3KMH1 1905 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 EXTL3O43909 919 aa16.75■□□□□ 0.27
TSNARE1-206ENST00000520462 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms