RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516021.1

SNORD46.2-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 46, humanhuman

BASIC

Gene SNORD46, Length 102 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD46.2-201ENST00000516021 ROR1Q01973 937 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 STK3Q13188 491 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PPP2R5DQ14738 602 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CCDC6Q16204 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 WDR44Q5JSH3 913 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 RTL10Q7L3V2 364 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 IRF7Q92985 503 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ASB16Q96NS5 453 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 FZD8Q9H461 694 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 GDAQ9Y2T3 454 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.5□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 THADAQ6YHU6 1953 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 FRYQ5TBA9 3013 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 K7ESF4 209 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PRRG1O14668 218 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CPLX1O14810 134 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 N4BP3O15049 544 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 AXIN1O15169 862 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 MOSPD3O75425 235 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 LYPLA2O95372 231 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ATF2P15336 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 LIG1P18858 919 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ELF1P32519 619 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SOX9P48436 509 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PTGDRQ13258 359 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 UPP1Q16831 310 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 FAM187BQ17R55 369 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 IL31Q6EBC2 164 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 Q6ZS52 159 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 LONP2Q86WA8 852 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 BSNDQ8WZ55 320 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SMARCD2Q92925 531 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 IER2Q9BTL4 223 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 POLD4Q9HCU8 107 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CEP72Q9P209 647 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PI4KAP42356 2102 aa6.49□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ARNTLO00327 626 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ACKR2O00590 384 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ZNF197O14709 1029 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ZNF263O14978 683 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TRAPPC3O43617 180 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CDC45O75419 566 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 MICAL2O94851 1124 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PRKCBP05771 671 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 MYL4P12829 197 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 ATP2B1P20020 1258 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PSMA5P28066 241 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CNR2P34972 360 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TXKP42681 527 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 SHC2P98077 582 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 NR5A1Q13285 461 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TEAD2Q15562 447 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.48□□□□□ -1.37
SNORD46.2-201ENST00000516021 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms