RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	GAP43	P17677	238 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MARK3	P27448	753 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TMOD1	P28289	359 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	JAK3	P52333	1124 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ERVFC1	P60507	584 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	IGBP1	P78318	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FAM189B	P81408	668 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCZ1B	P86790	482 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC63	Q05C16	580 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ANGPT1	Q15389	498 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NR6A1	Q15406	480 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FLCN	Q8NFG4	579 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	RUBCN	Q92622	972 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM169	Q96HH4	297 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	VPS16	Q9H269	839 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	WNT16	Q9UBV4	365 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LGALS16	A8MUM7	142 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183		C9IYK1	514 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MAGEB2	O15479	319 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FAM13A	O94988	1023 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LYPLA2	O95372	231 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TPM2	P07951	284 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MYB	P10242	640 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SFN	P31947	248 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PBX1	P40424	430 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EMP3	P54852	163 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PSMC5	P62195	406 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	UGCG	Q16739	394 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	RDM1	Q8NG50	284 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SHD	Q96IW2	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	POMK	Q9H5K3	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	POLD4	Q9HCU8	107 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KCND2	Q9NZV8	630 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NRDC	O43847	1150 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	HIP1R	O75146	1068 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	PSAP	P07602	524 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	KLRC1	P26715	233 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	CASP5	P51878	434 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	ARHGAP8	P85298	464 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	UBXN1	Q04323	297 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.24	1e-323	■■■□□ 18.3
RACK1-231	ENST00000514183	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	C4orf19	Q8IY42	314 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RACK1-231	ENST00000514183	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24

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