RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482507.5

ATG4B-220, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-220ENST00000482507 RAB20Q9NX57 234 aa15.89■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.89■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 IVDP26440 423 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 IFNAR2P48551 515 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PSMC5P62195 406 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CNGA2Q16280 664 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 FUKQ8N0W3 1084 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 C12orf42Q96LP6 360 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 NT5C1BQ96P26 610 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 VWA5AO00534 786 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 KIF3CO14782 793 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ACSL3O95573 720 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PPP1R7Q15435 360 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 FBXL18Q96ME1 805 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PWWP2AQ96N64 755 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RIPK3Q9Y572 518 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.88■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 O00370 1275 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CDR1P51861 262 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 HUNKP57058 714 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CYP24A1Q07973 514 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SGO2Q562F6 1265 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MFSD5Q6N075 450 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 FAM228AQ86W67 206 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC197Q8NCU1 140 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CCT8L1PA6NM43 557 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ASAP2O43150 1006 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 KRT5P13647 590 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PPIL2Q13356 520 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 OTUD6AQ7L8S5 288 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CPA5Q8WXQ8 436 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF516Q92618 1163 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SLCO2A1Q92959 643 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 IWS1Q96ST2 819 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TIPINQ9BVW5 301 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.87■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ZNF862O60290 1169 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RRM1P23921 792 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 DSG3P32926 999 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 WNT7BP56706 349 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MOGSQ13724 837 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 LRRC14Q15048 493 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TMC2Q8TDI7 906 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MYPNQ86TC9 1320 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 WDR64B1ANS9 1081 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CFHP08603 1231 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MAPK4P31152 587 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CALCOCO2Q13137 446 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 POMGNT1Q8WZA1 660 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ANKEF1Q9NU02 776 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.134e-14■■□□□ 13.9
ATG4B-220ENST00000482507 WHRNQ9P202 907 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.86■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 OTOFQ9HC10 1997 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 CXCL11O14625 94 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 STBD1O95210 358 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 GHRP10912 638 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 SCP2P22307 547 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 XRCC4Q13426 336 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 VSTM1Q6UX27 236 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 RMDN3Q96TC7 470 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ASIC3Q9UHC3 531 aa15.85■□□□□ 0.13
ATG4B-220ENST00000482507 ZBED4O75132 1171 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms