RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 Q6ZPA2 131 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 USP51Q70EK9 711 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 TTC7BQ86TV6 843 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RAB24Q969Q5 203 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PRSS23O95084 383 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PDCP20941 246 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SLC6A2P23975 617 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 AKAP5P24588 427 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SLC6A4P31645 630 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CEP89Q96ST8 783 aa7.25□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 E2F8A0AVK6 867 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SLPIP03973 132 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CFIP05156 583 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ELANEP08246 267 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SPATA31D3P0C874 917 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 LAG3P18627 525 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 KLF10Q13118 480 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 USP45Q70EL2 814 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RSPH3Q86UC2 560 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MLST8Q9BVC4 326 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.24□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 GRM6O15303 877 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 AKAP10O43572 662 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SBK3P0C264 359 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 VCAM1P19320 739 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ATP2B3Q16720 1220 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF627Q7L945 461 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SYNE4Q8N205 404 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FITM2Q8N6M3 262 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ADAM2Q99965 735 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SRRDQ9UH36 339 aa7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CCDC78A2IDD5 438 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 SLC43A1O75387 559 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 HAUS5O94927 633 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ADH4P08319 380 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CKBP12277 381 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 KRT4P19013 534 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 EPHB1P54762 984 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CREMQ03060 361 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 OCA2Q04671 838 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PRDM2Q13029 1718 aa7.21□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 A0A1B0GTW7 788 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 SLC16A6O15403 523 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 IL33O95760 270 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 ABHD16AO95870 558 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 MALP21145 153 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 SLFN5Q08AF3 891 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 SNAPC2Q13487 334 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.21□□□□□ -1.26
GTF2I-208ENST00000482232 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms