RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 UBE4BO95155 1302 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DLL1O00548 723 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 MBTPS2O43462 519 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 MYL1P05976 194 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GARTP22102 1010 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CREMQ03060 361 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 RTP2Q5QGT7 225 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CEP57Q86XR8 500 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 GPR65Q8IYL9 337 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TTPALQ9BTX7 342 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.62■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TEX28O15482 410 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TRAPPC3O43617 180 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ADRB2P07550 413 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 EPCAMP16422 314 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 EXOC1Q9NV70 894 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.61■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TSC2P49815 1807 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CLCN4P51793 760 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 JADE1Q6IE81 842 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SAAL1Q96ER3 474 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.6■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KLRC4O43908 158 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CYP3A5P20815 502 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 BRCC3P46736 316 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB6Q15916 424 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PDXDC1Q6P996 788 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ASB7Q9H672 318 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.59■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SCN1AP35498 2009 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 I3L4J1 428 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 ZNF202O95125 648 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 NFICP08651 508 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PSMD5Q16401 504 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 BEST2Q8NFU1 509 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 APOL5Q9BWW9 433 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 FNIP2Q9P278 1114 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 DERAQ9Y315 318 aa22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NELFE-208ENST00000481121 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 IL18RAPO95256 599 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GLUD1P00367 558 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 PRR29P0C7W0 189 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 FGFR3P22607 806 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 LRPAP1P30533 357 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 MCM4P33991 863 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 HOXD13P35453 343 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.57■■□□□ 1.2
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NELFE-208ENST00000481121 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 C2CD2Q9Y426 696 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 EXTL3O43909 919 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 SPATA1Q5VX52 437 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GPD1LQ8N335 351 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NELFE-208ENST00000481121 GUCY2FP51841 1108 aa22.56■■□□□ 1.2
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