RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 SLC14A1Q13336 389 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 C8orf34Q49A92 452 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PMS2CLQ68D20 193 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ING5Q8WYH8 240 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SCLT1Q96NL6 688 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CEP89Q96ST8 783 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 EBF1Q9UH73 591 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 IL17BQ9UHF5 180 aa8.75□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 LAMA5O15230 3695 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PATE3B3GLJ2 98 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 F8W810 466 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 DYNC1I1O14576 645 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CHADO15335 359 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 MSH4O15457 936 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SLC28A2O43868 658 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 STBD1O95210 358 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TDP2O95551 362 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 EFEMP2O95967 443 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PSAPP07602 524 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CYP3A4P08684 503 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ENGP17813 658 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CCINQ13939 588 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 KSR1Q8IVT5 923 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TMTC2Q8N394 836 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 NLRP7Q8WX94 980 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PIGKQ92643 395 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ARID3AQ99856 593 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 GPR88Q9GZN0 384 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SAMM50Q9Y512 469 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 NUP205Q92621 2012 aa8.74□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 A0A087WZ62 844 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ESYT2A0FGR8 921 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 WDR64B1ANS9 1081 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 DTNBO60941 627 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 RHOP08100 348 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 C6P13671 934 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 IL12RB1P42701 662 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 RHDQ02161 417 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 MTERF2Q49AM1 385 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 VITQ6UXI7 678 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SYT12Q8IV01 421 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CNNM3Q8NE01 707 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 CEP76Q8TAP6 659 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 SMARCD2Q92925 531 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 EXOC4Q96A65 974 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ASB16Q96NS5 453 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 RSAD1Q9HA92 442 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 DISC1Q9NRI5 854 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.73□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 HAX1O00165 279 aa8.72□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 APBB3O95704 486 aa8.72□□□□□ -1.01
SZRD1-208ENST00000476423 FCARP24071 287 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms