RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PWWP2AQ96N64 755 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 STK32BQ9NY57 414 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC23Q9UJX2 597 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087WV62 115 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PPC4 97 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT10BO00744 389 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 APOL1O14791 398 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 NPHP1O15259 732 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 GRM6O15303 877 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP6O43182 974 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PPFIA4O75335 1185 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SASH1O94885 1247 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PI3P19957 117 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TECP42680 631 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 GZMKP49863 264 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 APBA1Q02410 837 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SSPNQ14714 243 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC93Q567U6 631 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MCTP2Q6DN12 878 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CPXCR1Q8N123 301 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL8AQ96BM9 186 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP95Q96GE4 821 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SCLT1Q96NL6 688 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNH6Q9H252 994 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RLIMQ9NVW2 624 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 LUZP4Q9P127 313 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 COL20A1Q9P218 1284 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RFXAPO00287 272 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTS3O15072 1205 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP5JP18859 108 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 HDCP19113 662 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 GRK6P43250 576 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNJ5P48544 419 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPK10P53779 464 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ICA1Q05084 483 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 POU5F1BQ06416 359 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMYM3Q14202 1370 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF22Q14807 665 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TBR1Q16650 682 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR16Q569H4 304 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CARFQ8N187 725 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MAML1Q92585 1016 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RABGGTAQ92696 567 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 MBD6Q96DN6 1003 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 GPHA2Q96T91 129 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 IL23AQ9NPF7 189 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SERHLQ9NQF3 203 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 NCDNQ9UBB6 729 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SRRDQ9UH36 339 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 PJA2O43164 708 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD16AO95870 558 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SBK3P0C264 359 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA7P48741 367 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 NPEPPSP55786 919 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC13A2Q13183 592 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms