RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFA10O95299 355 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FGFR1P11362 822 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 NEFHP12036 1026 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GUCY2DQ02846 1103 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 E2F5Q15329 346 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 NTRK3Q16288 839 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 EPC2Q52LR7 807 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PAF1Q8N7H5 531 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PANX2Q96RD6 677 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 MMS19Q96T76 1030 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GAD1Q99259 594 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TLR9Q9NR96 1032 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 MYH8P13535 1937 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 OPLAHO14841 1288 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CYP11B2P19099 503 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 EPHB4P54760 987 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GIT2Q14161 759 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PDIA5Q14554 519 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 KYAT1Q16773 422 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TOP1MTQ969P6 601 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CHP1Q99653 195 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 KATNBL1Q9H079 304 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM150BA6NC51 233 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 E9PMD0 336 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 NBNO60934 754 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PSMD10O75832 226 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 RPA1P27694 616 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GPC3P51654 580 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 NCAPHQ15003 741 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 IFT20Q8IY31 132 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 APPL2Q8NEU8 664 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 LPPQ93052 612 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PAGE5Q96GU1 130 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CPB2Q96IY4 423 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FAM205CA6NFA0 338 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF185O15231 689 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CEP104O60308 925 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 EYA4O95677 639 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 SLC8A3P57103 927 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PPP2R5CQ13362 524 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PALB2Q86YC2 1186 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FBXL16Q8N461 479 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 KIF12Q96FN5 646 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 TIPINQ9BVW5 301 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0U1RQJ8 604 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 EXOC3O60645 756 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FGF18O76093 207 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 MOCS3O95396 460 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 GAP43P17677 238 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 BCAR1P56945 870 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC25Q86WR0 208 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 ACCSQ96QU6 501 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-205ENST00000468371 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms