RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT2P49753 483 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 LIG4P49917 911 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCN4P51793 760 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA8P51970 172 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ADALQ6DHV7 355 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 HACE1Q8IYU2 909 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SUSD6Q92537 303 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 BICD1Q96G01 975 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA32Q96LK8 384 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TNMDQ9H2S6 317 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP45Q9UL16 551 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf72A6NCS6 295 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 PODXLO00592 558 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFB1I1O43294 461 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 NCK2O43639 380 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 NFICP08651 508 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 GAP43P17677 238 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 CMA1P23946 247 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 GLUD2P49448 558 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT85P78386 507 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 AAK1Q2M2I8 961 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 JADE1Q6IE81 842 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRA6Q6PI73 481 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 PALB2Q86YC2 1186 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 IQUBQ8NA54 791 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SAAL1Q96ER3 474 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 PAGE5Q96GU1 130 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHX3Q9H6B9 360 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 TECTAO75443 2155 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YCG3 227 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 CLTAP09496 248 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 FGFR3P22607 806 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRC2P26717 231 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZP2Q05996 745 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 BECN1Q14457 450 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 USP41Q3LFD5 358 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R3CQ969Q6 453 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-206ENST00000461017 CUEDC2Q9H467 287 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 POMKQ9H5K3 350 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-206ENST00000461017 FNIP2Q9P278 1114 aa7.63□□□□□ -1.19
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