RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEZ6Q53EL9 994 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARSHQ5FYA8 562 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF13Q92913 245 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNN1Q92952 543 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NXPE3Q969Y0 559 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 UROC1Q96N76 676 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDH7Q9ULB5 785 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNM3Q9UQ16 869 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.27□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC169A6NNP5 214 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRN2O75325 713 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC24AO95486 1093 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 VNN2O95498 520 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCF2P10911 925 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJB2P29033 226 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCKAP1LP55160 1127 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRIN1Q05586 938 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RABEP1Q15276 862 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANGPT1Q15389 498 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIN9Q5TKA1 542 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT79Q5XKE5 535 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DRC1Q96MC2 740 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FIZ1Q96SL8 496 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLIN2Q99541 437 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB34Q9BZG1 259 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCANO14594 1321 aa9.26□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PODXLO00592 558 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOSPD3O75425 235 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLS3P13797 630 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCARP24071 287 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFSF9P41273 254 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCR2P41597 374 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 STARD6P59095 220 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPC5P78333 572 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB6Q15916 424 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 UVSSAQ2YD98 709 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDXDC1Q6P996 788 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ING5Q8WYH8 240 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUSD3Q96L08 255 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACAP3Q96P50 834 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXQ1Q9C009 403 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK24Q9Y6E0 443 aa9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC26A0AVF1 554 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms