RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 KCNA1Q09470 495 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 GPR65Q8IYL9 337 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC19Q96DA6 116 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 FAM212AQ96EL1 285 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 KIF12Q96FN5 646 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 PIDD1Q9HB75 910 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 MTRRQ9UBK8 725 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 CLUHO75153 1309 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-209ENST00000439106 TTC26A0AVF1 554 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 LACTBL1A8MY62 500 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SPTLC2O15270 562 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 OGTO15294 1046 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZMYND10O75800 440 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 F13A1P00488 732 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 C8AP07357 584 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CLTAP09496 248 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 IDEP14735 1019 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 NTHL1P78549 312 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC14Q08ET2 396 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SV2BQ7L1I2 683 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 KCNN1Q92952 543 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PPEF2O14830 753 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CCL16O15467 120 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MCM4P33991 863 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ACOT2P49753 483 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CASP5P51878 434 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ARPP19P56211 112 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 LIN9Q5TKA1 542 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ASIC4Q96FT7 647 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MYADMQ96S97 322 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 DPP7Q9UHL4 492 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 POLIQ9UNA4 740 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 USTQ9Y2C2 406 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 A0A0B4J269 797 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC3O43617 180 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R37O75864 691 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 NFICP08651 508 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ROR1Q01973 937 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 MTMR3Q13615 1198 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 RAB33AQ14088 237 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PPM1LQ5SGD2 360 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ADALQ6DHV7 355 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 JADE1Q6IE81 842 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PDXDC1Q6P996 788 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 SHC4Q6S5L8 630 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CHAMP1Q96JM3 812 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-209ENST00000439106 WDR27A2RRH5 827 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 PPP6R2O75170 966 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 GCNT3O95395 438 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 YEATS4O95619 227 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB6Q15916 424 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 E2F4Q16254 413 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 HPS3Q969F9 1004 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 DHX58Q96C10 678 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 FAM84AQ96KN4 292 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 SUSD3Q96L08 255 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 STRA6Q9BX79 667 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-209ENST00000439106 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms