RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 LLGL1Q15334 1064 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 KAT5Q92993 513 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SH3GL3Q99963 347 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CHKBQ9Y259 395 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 GCLMP48507 274 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ADCY1Q08828 1119 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RASA3Q14644 834 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC37BQ96QE4 947 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.89■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RASA4BC9J798 803 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3CDO00329 1044 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK13O15264 365 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RASA4O43374 803 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TPBGLP0DKB5 382 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ARP10275 920 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ADCY8P40145 1251 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RAD23BP54727 409 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R5CQ13362 524 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NSMFQ6X4W1 530 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RELL1Q8IUW5 271 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 FAM13CQ8NE31 585 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ABLIM1O14639 778 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CYP26A1O43174 497 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PSMD10O75832 226 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DCTN3O75935 186 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MUTP22033 750 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MOGSQ13724 837 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NACC1Q96RE7 527 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DCLK3Q9C098 648 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 HAO1Q9UJM8 370 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.88■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ENO4A6NNW6 628 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ASMTLO95671 621 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ATP4AP20648 1035 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6V1C1P21283 382 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ANO7Q6IWH7 933 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ATL2Q8NHH9 583 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 FAM151AQ8WW52 585 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PWWP2AQ96N64 755 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 USP20Q9Y2K6 914 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TMED2Q15363 201 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CEP55Q53EZ4 464 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RGS9BPQ6ZS82 235 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 BBOF1Q8ND07 529 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MAML1Q92585 1016 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PCIF1Q9H4Z3 704 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ACP6Q9NPH0 428 aa15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ABHD2P08910 425 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 GM2AP17900 193 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ALDH3A1P30838 453 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PRELPP51888 382 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NR1H3Q13133 447 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC3Q13217 504 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LDHDQ86WU2 507 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MXI1P50539 228 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RASSF2P50749 326 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SHC3Q92529 594 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLC5A5Q92911 643 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf72Q96LT7 481 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms