RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435576.2

TRABD2B-201, Transcript of TraB domain containing 2B, humanhuman

TSL 3

Gene TRABD2B, Length 619 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2B-201ENST00000435576 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CD302Q8IX05 232 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CLEC1BQ9P126 229 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SCN1AP35498 2009 aa14.93□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CLIC2O15247 247 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 EXTL3O43909 919 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 URODP06132 367 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 LRPAP1P30533 357 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 BRCC3P46736 316 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KCNB1Q14721 858 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 USP41Q3LFD5 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RTP2Q5QGT7 225 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 GPD1LQ8N335 351 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TIGD1Q96MW7 591 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 ASB2Q96Q27 587 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 ASB7Q9H672 318 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 I3L4J1 428 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 PPEF2O14830 753 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CYP3A5P20815 502 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 NDUFV1P49821 464 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SPATA1Q5VX52 437 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 DERAQ9Y315 318 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 C2CD2Q9Y426 696 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.91□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TEX28O15482 410 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 IL18RAPO95256 599 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 FGFR3P22607 806 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 UBE2HP62256 183 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CLUL1Q15846 466 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CEP57Q86XR8 500 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SPATA20Q8TB22 786 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 FAM84AQ96KN4 292 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 FBXL18Q96ME1 805 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TTPALQ9BTX7 342 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.9□□□□□ -0.02
TRABD2B-201ENST00000435576 TSC2P49815 1807 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 FSD2A1L4K1 749 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 TNFRSF10AO00220 468 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 BMP1P13497 986 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 EPCAMP16422 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CYP2J2P51589 502 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 CLCN4P51793 760 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 AAK1Q2M2I8 961 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRABD2B-201ENST00000435576 GPR65Q8IYL9 337 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms