RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 TMEM270Q6UE05 265 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ERO1BQ86YB8 467 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MAF1Q9H063 256 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SNX24Q9Y343 169 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PHF2O75151 1096 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CLTAP09496 248 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NF2P35240 595 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ZNF844Q08AG5 666 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PPFIA1Q13136 1202 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MON1BQ7L1V2 547 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CD302Q8IX05 232 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CEP120Q8N960 986 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 OPTNQ96CV9 577 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ERP44Q9BS26 406 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.92□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PLXNB2O15031 1838 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CCDC66A2RUB6 948 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 B4GALT5O43286 388 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 RPS6KA5O75582 802 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PLCB4Q15147 1175 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 WDR44Q5JSH3 913 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 RNF149Q8NC42 400 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.91□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MYO1FO00160 1098 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CLDN3O15551 220 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 IQCF3P0C7M6 154 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SCP2P22307 547 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 IRAK1P51617 712 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NOMO3P69849 1222 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CENPCQ03188 943 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PDCLQ13371 301 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 NCOA4Q13772 614 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TMEM192Q8IY95 271 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 LGR5O75473 907 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TGFB3P10600 412 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CYP2C8P10632 490 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PSEN1P49768 467 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PTP4A2Q12974 167 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 WDR78Q5VTH9 848 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 UBR7Q8N806 425 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 FAM212AQ96EL1 285 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.9□□□□□ -0.02
RBM39-212ENST00000429968 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.89□□□□□ -0.03
RBM39-212ENST00000429968 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms