RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM192Q8IY95 271 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCOLN2Q8IZK6 566 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSD3Q9NYI0 1048 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USTQ9Y2C2 406 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 THAP12O43422 761 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OPA1O60313 960 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRKCBP05771 671 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WEE2P0C1S8 567 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RFC5P40937 340 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYL6P60660 151 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLCB4Q15147 1175 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JAMLQ86YT9 394 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD101Q93033 1021 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYT17Q9BSW7 474 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPHX2P34913 555 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HADHBP55084 474 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLDN10P78369 228 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CUL1Q13616 776 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC31Q6UY01 552 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CGRRF1Q99675 332 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLTAP09496 248 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RARAP10276 462 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TGFB3P10600 412 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HPDP32754 393 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPFIA1Q13136 1202 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ORC1Q13415 861 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HEMGNQ9BXL5 484 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC66A2RUB6 948 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD65E5RJM6 399 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CXCL11O14625 94 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIGRP01833 764 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IQCF3P0C7M6 154 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDCLQ13371 301 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAPK6Q16659 721 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GOLGA8KD6RF30 607 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERP44Q9BS26 406 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.52□□□□□ -0.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM189A1O60320 539 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TOM1L1O75674 476 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRT19P08727 400 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FMO2Q99518 471 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYO1FO00160 1098 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZEB2O60315 1214 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHF2O75151 1096 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MTA2O94776 668 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A27O95847 323 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF286BP0CG31 522 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAP1GAPP47736 663 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RWDD2BP57060 319 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNGT1P63211 74 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms