RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 BCAS4Q8TDM0 211 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 CPA5Q8WXQ8 436 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 ZEB2O60315 1214 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 RARAP10276 462 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 RRM1P23921 792 aa29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CERS1-201ENST00000429504 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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CERS1-201ENST00000429504 PLTPP55058 493 aa29.51■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 LRRC19Q9H756 370 aa29.51■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 AP3M2P53677 418 aa29.51■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa29.51■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 FAM129AQ9BZQ8 928 aa29.51■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 AZI2Q9H6S1 392 aa29.51■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa29.51■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 IRF6O14896 467 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CLDN3O15551 220 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 GRM1Q13255 1194 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 TMEM270Q6UE05 265 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 SLCO2A1Q92959 643 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CYFIP2Q96F07 1278 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CENPHQ9H3R5 247 aa29.5■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 NCOA4Q13772 614 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 IER5Q5VY09 327 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 ILDR2Q71H61 639 aa29.49■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 NOMO3P69849 1222 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 DRP2Q13474 957 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 LIN9Q5TKA1 542 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 SULF1Q8IWU6 871 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 PASKQ96RG2 1323 aa29.49■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 FAM189A1O60320 539 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 MSCO60682 206 aa29.48■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 SLC25A27O95847 323 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 POTEJP0CG39 1038 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 LSP1P33241 339 aa29.48■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 TRIM7Q9C029 511 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 EPB41L4BQ9H329 900 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CNMDO75829 334 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PMS2P54278 862 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 GUCY1A3Q02108 690 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 LY6KQ17RY6 165 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 WDR49Q8IV35 697 aa29.48■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 MAIP1Q8WWC4 291 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 TCP11Q8WWU5 503 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 IMPG2Q9BZV3 1241 aa29.48■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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CERS1-201ENST00000429504 LGR5O75473 907 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 PROSCO94903 275 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 ECEL1O95672 775 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 KRT71Q3SY84 523 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 HPDP32754 393 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 CCT5P48643 541 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 IFFO1Q0D2I5 559 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 EEPD1Q7L9B9 569 aa29.46■■■□□ 2.31
CERS1-201ENST00000429504 ERO1BQ86YB8 467 aa29.46■■■□□ 2.31
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