RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC42Q9Y546 428 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTNAP1P78357 1384 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 P4HA2O15460 535 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ITIH2P19823 946 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXN2P32314 431 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY1Q08828 1119 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBPC2Q14324 1141 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 KYNUQ16719 465 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 NIM1KQ8IY84 436 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 XXYLT1Q8NBI6 393 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO41Q8TF61 875 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO2A1Q92959 643 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PWWP2AQ96N64 755 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM39BQ9GZU3 492 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEA3O75764 348 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TNIP1Q15025 636 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA4DQ92854 862 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3GL3Q99963 347 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TEKT3Q9BXF9 490 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 LRMDAQ9H2I8 198 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM206Q9H813 350 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TBK1Q9UHD2 729 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF3C4Q9UKN8 822 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa19.51■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ADRB2P07550 413 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CETPP11597 493 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP11B1P15538 503 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 MUTP22033 750 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CALB2P22676 271 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 INHBEP58166 350 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 STRN3Q13033 797 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GNT9Q6UX72 402 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 HERPUD2Q9BSE4 406 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PITPNM3Q9BZ71 974 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 LGALS13Q9UHV8 139 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX11AO75192 247 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CALCAP01258 141 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 VTI1AQ96AJ9 217 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ACCSQ96QU6 501 aa19.5■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 FSCN2O14926 492 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 THAP12O43422 761 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP5HO75947 161 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP4AP20648 1035 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 IVDP26440 423 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS41P49754 854 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA8P53708 1063 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP19.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 35.5
RALGPS1-208ENST00000424082 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ACER1Q8TDN7 264 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SHC3Q92529 594 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC127Q96BQ5 260 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SNF8Q96H20 258 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 NINJ2Q9NZG7 142 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM150BA6NC51 233 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 E7ENQ6 273 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO7Q6IWH7 933 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM47EQ6ZV65 393 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CBWD2Q8IUF1 395 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM151AQ8WW52 585 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 UVRAGQ9P2Y5 699 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEJP0CG39 1038 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 VSIG1Q86XK7 387 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 STK32AQ8WU08 396 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ANAPC7Q9UJX3 599 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD23BP54727 409 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 MFAP3P55082 362 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 IL9RQ01113 521 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 CDR2Q01850 454 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 SETDB1Q15047 1291 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 HAUS6Q7Z4H7 955 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 PARD3BQ8TEW8 1205 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ERP27Q96DN0 273 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM237Q96Q45 408 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 GPRC5CQ9NQ84 441 aa19.48■□□□□ 0.71
RALGPS1-208ENST00000424082 ZHX2Q9Y6X8 837 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms