RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 IFT43Q96FT9 208 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TTC25Q96NG3 672 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 AGPAT1Q99943 283 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 NUP85Q9BW27 656 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GMEB1Q9Y692 573 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 POTEFA5A3E0 1075 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 SPATA31D3P0C874 917 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 POTEIP0CG38 1075 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GRM4Q14833 912 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 RASA2Q15283 850 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZBED8Q8IZ13 594 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ERMNQ8TAM6 284 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CLPTM1LQ96KA5 538 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.01□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MYH7P12883 1935 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ADAMTS2O95450 1211 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MYL2P10916 166 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CTNNA2P26232 953 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GJA8P48165 433 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 HPCAP84074 193 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 SLC1A5Q15758 541 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 KAZNQ674X7 775 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 VGLL2Q8N8G2 317 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GRIP2Q9C0E4 1043 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF180Q9UJW8 692 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA8SH3BPF8 625 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 FCHO1O14526 889 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 E2F6O75461 281 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CETPP11597 493 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MYL7Q01449 175 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CYP4A11Q02928 519 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PPATQ06203 517 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 UBE2SQ16763 222 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MYCT1Q8N699 235 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 DAGLBQ8NCG7 672 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PHF12Q96QT6 1004 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PFDN4Q9NQP4 134 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CHST7Q9NS84 486 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 COG5Q9UP83 839 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ACTL7BQ9Y614 415 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 RIC1Q4ADV7 1423 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MOGSQ13724 837 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 HIC1Q14526 733 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 EPHA7Q15375 998 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 IYDQ6PHW0 289 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TRABD2AQ86V40 505 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 DNAJC19Q96DA6 116 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF287Q9HBT7 754 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CYTH3O43739 400 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MT-ND3P03897 115 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MAPK4P31152 587 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 CHRNDQ07001 517 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MTM1Q13496 603 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 POTEGQ6S5H5 508 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TMPRSS6Q8IU80 811 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TRIML2Q8N7C3 387 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 KIAA1586Q9HCI6 787 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 SLAIN2Q9P270 581 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 PDK3Q15120 406 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 OLFML1Q6UWY5 402 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 ANO5Q75V66 913 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 KLHL4Q9C0H6 718 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.99□□□□□ -0.33
SZRD1-201ENST00000401088 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms