RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 EFCC1Q9HA90 598 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SCINQ9Y6U3 715 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 BCORQ6W2J9 1755 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 H7C0C1 242 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 AGTP01019 485 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 MAP2K2P36507 400 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ATP5OP48047 213 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 IL9RQ01113 521 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF699Q32M78 642 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CCNE2O96020 404 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 FMO1Q01740 532 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 MAPK6Q16659 721 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 KLC4Q9NSK0 619 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 RIPK3Q9Y572 518 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 GTF2H1P32780 548 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 STAT5BP51692 787 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF568Q3ZCX4 644 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ANO5Q75V66 913 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 TIPINQ9BVW5 301 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 MYH1P12882 1939 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 VWA5AO00534 786 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 TJP3O95049 919 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 LMNB2Q03252 620 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF449Q6P9G9 518 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 KCTD6Q8NC69 237 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 AKT3Q9Y243 479 aa11.26□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 GOLGA8RI6L899 631 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PEX10O60683 326 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 GTF2BQ00403 316 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 KRT81Q14533 505 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CCDC6Q16204 474 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 FAM83AQ86UY5 434 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 APOL6Q9BWW8 343 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 NCANO14594 1321 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PLSCR1O15162 318 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 EXTL3O43909 919 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 MYBPC2Q14324 1141 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 DUPD1Q68J44 220 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CASC4Q6P4E1 433 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 GINM1Q9NU53 330 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 RARGP13631 454 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 ITIH2P19823 946 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 BACE1P56817 501 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 MXRA7P84157 204 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 QPCTQ16769 361 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CD302Q8IX05 232 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 BSNDQ8WZ55 320 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 CD248Q9HCU0 757 aa11.25□□□□□ -0.61
ZNF549-202ENST00000376233 PARVAQ9NVD7 372 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms