RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 RPTORQ8N122 1335 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MED24O75448 989 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GFPT2O94808 682 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 NOVP48745 357 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GALCP54803 685 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TTLL4Q14679 1199 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GALNTL6Q49A17 601 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 Q4G0T1 1027 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 GJB7Q6PEY0 223 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 USP37Q86T82 979 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 TBK1Q9UHD2 729 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.9□□□□□ -0.5
RPRD1B-201ENST00000373433 ASB14A6NK59 587 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GH1P01241 217 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 KRT5P13647 590 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GAP43P17677 238 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 NR2F2P24468 414 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RFC5P40937 340 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RANBP1P43487 201 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 KLC1Q07866 573 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SEC14L1Q92503 715 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 HAS1Q92839 578 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 MTMR9Q96QG7 549 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SYT15Q9BQS2 421 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CPA4Q9UI42 421 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 DOCK2Q92608 1830 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 MAFGO15525 162 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 EYA4O95677 639 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 KRT19P08727 400 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF220Q5VTB9 566 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CLIC2O15247 247 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PEX3P56589 373 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 MAPK7Q13164 816 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SETDB1Q15047 1291 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC6Q16204 474 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 ERP27Q96DN0 273 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SPATA33Q96N06 139 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 MROH8Q9H579 483 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SPC25Q9HBM1 224 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GNA14O95837 355 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CALB2P22676 271 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CROCCP2Q86T23 111 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 IL31RAQ8NI17 732 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 HES6Q96HZ4 224 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 WNK4Q96J92 1243 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 IWS1Q96ST2 819 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF302Q9NR11 478 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 HAO1Q9UJM8 370 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 RIPK2O43353 540 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PYGLP06737 847 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 BRAFP15056 766 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP2B6P20813 491 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 PLCB3Q01970 1234 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GPRASP2Q96D09 838 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 CEP63Q96MT8 703 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 KMT5AQ9NQR1 393 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.88□□□□□ -0.51
RPRD1B-201ENST00000373433 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms