RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370291.6

CSAG1-203, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 1,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-203ENST00000370291 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 SPATA1Q5VX52 437 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 JADE1Q6IE81 842 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 TAS1R1Q7RTX1 841 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 EFHBQ8N7U6 833 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 BEST2Q8NFU1 509 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 SPATA20Q8TB22 786 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 SMARCE1Q969G3 411 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 FBXL18Q96ME1 805 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 GBP4Q96PP9 640 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 CHST7Q9NS84 486 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 THEGQ9P2T0 379 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG1-203ENST00000370291 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PER2O15055 1255 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 LILRB3O75022 631 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 ADAM15Q13444 863 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 SURF1Q15526 300 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CD300LGQ6UXG3 332 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 HASPINQ8TF76 798 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CLDND1Q9NY35 253 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.08■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 NFICP08651 508 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PAX3P23760 479 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CREMQ03060 361 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 MYBPC2Q14324 1141 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 AAK1Q2M2I8 961 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PDXDC1Q6P996 788 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 TTPALQ9BTX7 342 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.07■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 VWA8A3KMH1 1905 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 C2CD2LO14523 706 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 EXOC3O60645 756 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 FGFR3P22607 806 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CYP2J2P51589 502 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 KLHL5Q96PQ7 755 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 DMAC2Q9NW81 257 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 DPP3Q9NY33 737 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 FNIP2Q9P278 1114 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.06■□□□□ 0
CSAG1-203ENST00000370291 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 PIRO00625 290 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 LTBRP36941 435 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 BRCC3P46736 316 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 KCNC3Q14003 757 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 NFIL3Q16649 462 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 RTP2Q5QGT7 225 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 CEP57Q86XR8 500 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 RDH13Q8NBN7 331 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 CASP10Q92851 521 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 B3GALT6Q96L58 329 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 LMBRD1Q9NUN5 540 aa15.05■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 SCN1AP35498 2009 aa15.04■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CSAG1-203ENST00000370291 ANO9A1A5B4 782 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms