RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP73A6NFT4 308 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DFFAO00273 331 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ACCSLQ4AC99 568 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 IL25Q9H293 177 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PFDN1O60925 122 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RGS7P49802 495 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 IER5Q5VY09 327 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 GGA3Q9NZ52 723 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RNF135Q8IUD6 432 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD14O00487 310 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 POLE2P56282 527 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 P3H1Q32P28 736 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CENPKQ9BS16 269 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SULT1E1P49888 294 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 UGP2Q16851 508 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PPCSQ9HAB8 311 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ADA2Q9NZK5 511 aa21.34■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 E2F4Q16254 413 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 FAM161BQ96MY7 647 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HBP1O60381 514 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 GRIK1P39086 918 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MAPRE2Q15555 327 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RPAINQ86UA6 219 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MCEEQ96PE7 176 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PIDD1Q9HB75 910 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF197O14709 1029 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HADHAP40939 763 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF677Q86XU0 584 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.33■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ING2Q9H160 280 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRMP28827 1452 aa21.33■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD3O43242 534 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM259Q4ZIN3 620 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ANKS1AQ92625 1134 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP11B2P19099 503 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AP2B1P63010 937 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ALG6Q9Y672 507 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY1A3Q02108 690 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EXTL3O43909 919 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SZRD1Q7Z422 152 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf72Q96LT7 481 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.32■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SMAPO00193 183 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 NPEPPSP55786 919 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ATG4CQ96DT6 458 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 COMTP21964 271 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TBCCQ15814 346 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RAET1EQ8TD07 263 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KRT35Q92764 455 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GPRASP2Q96D09 838 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP3Q96P47 875 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms