RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.88■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TNIP3Q96KP6 325 aa16.88■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 LY9Q9HBG7 655 aa16.88■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 GALNT4Q8N4A0 578 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 MS4A14Q96JA4 679 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ZNF185O15231 689 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 CDC27P30260 824 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SPP2Q13103 211 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 FAM162AQ96A26 154 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 BARHL2Q9NY43 387 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 AP3M2P53677 418 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PTPRN2Q92932 1015 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ZFP42Q96MM3 310 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TASP1Q9H6P5 420 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SLC1A1P43005 524 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RGS7P49802 495 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RUNX1T1Q06455 604 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ANGPT1Q15389 498 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 FOXN1O15353 648 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 AGTP01019 485 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 FOPNLQ96NB1 174 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 KIF2CQ99661 725 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PKP3Q9Y446 797 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PALLDQ8WX93 1383 aa16.87■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 AIM2O14862 343 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 CYBBP04839 570 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 HMBSP08397 361 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 VSNL1P62760 191 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RNF149Q8NC42 400 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TMEM245Q9H330 911 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 GUCA1CO95843 209 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 MTF1Q14872 753 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 EFHBQ8N7U6 833 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ECE2O60344 883 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 NDUFS3O75489 264 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SLC9A1P19634 815 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C18orf8Q96DM3 657 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 33.2
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RXRA-201ENST00000356384 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RNF181Q9P0P0 153 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.86■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R37O75864 691 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 FAM107AO95990 144 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 RPS6P62753 249 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 HLFQ16534 295 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 USE1Q9NZ43 259 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 BLOC1S6Q9UL45 172 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SATB2Q9UPW6 733 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 E9PCH4 1651 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 H7C1W4 665 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C16orf89Q6UX73 402 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C11orf74Q86VG3 221 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SNX31Q8N9S9 440 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 THTPAQ9BU02 230 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ACAD9Q9H845 621 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 CD274Q9NZQ7 290 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.85■□□□□ 0.29
RXRA-201ENST00000356384 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.85■□□□□ 0.29
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