RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ZACNQ401N2 412 aa30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 FILIP1LQ4L180 1135 aa30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 SV2AQ7L0J3 742 aa30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 CETN1Q12798 172 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 NAB2Q15742 525 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 ITGA11Q9UKX5 1188 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 PMM2O15305 246 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 P4HA2O15460 535 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa30■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 RAD9AQ99638 391 aa30■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 PHACTR2O75167 634 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 MYL7Q01449 175 aa29.99■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 CBWD3Q5JTY5 395 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 CBWD5Q5RIA9 395 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.99■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 COL4A6Q14031 1691 aa29.99■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 DSC1Q08554 894 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 FKBP15Q5T1M5 1219 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 FAM84AQ96KN4 292 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 UROC1Q96N76 676 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS16A8MUM7 142 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TLL1O43897 1013 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 LRPAP1P30533 357 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa29.98■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 ITGB3P05106 788 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 RPL9P32969 192 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 PLCB2Q00722 1185 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TRPC3Q13507 836 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 FBXL13Q8NEE6 735 aa29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GTH6 734 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 DDHD2O94830 711 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 KRT19P08727 400 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 TDHQ8IZJ6 230 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.96■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 TPM3P06753 285 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 RBP5P82980 135 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 SARM1Q6SZW1 724 aa29.95■■■□□ 2.39
GIPC1-201ENST00000345425 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
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GIPC1-201ENST00000345425 C9orf57Q5W0N0 161 aa29.95■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.95■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 IFNKQ9P0W0 207 aa29.95■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 SIX4Q9UIU6 781 aa29.95■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 ANO9A1A5B4 782 aa29.94■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 CBFA2T2O43439 604 aa29.94■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 TAS1R2Q8TE23 839 aa29.94■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 IMPG2Q9BZV3 1241 aa29.93■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 PNPLA4P41247 253 aa29.92■■■□□ 2.38
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GIPC1-201ENST00000345425 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC150Q8NCX0 1101 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 GCNT4Q9P109 453 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 FSD2A1L4K1 749 aa29.92■■■□□ 2.38
GIPC1-201ENST00000345425 PIRO00625 290 aa29.92■■■□□ 2.38
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