RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ABCB6Q9NP58 842 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.661e-16■■■□□ 16.1
ACTB-201ENST00000331789 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CTGFP29279 349 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RGS2P41220 211 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ITIH3Q06033 890 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RHOT2Q8IXI1 618 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 AMFRQ9UKV5 643 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RRN3P2A6NIE6 340 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ASS1P00966 412 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 STAG3L1P0CL83 205 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 MCF2P10911 925 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 FGFR4P22455 802 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ACAD10Q6JQN1 1059 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TMEM270Q6UE05 265 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RNF14Q9UBS8 474 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CCDC151A5D8V7 595 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 LACTBL1A8MY62 500 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM191BP0C7N4 346 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 BPIFB4P59827 614 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TCEAL1Q15170 157 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 HES6Q96HZ4 224 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN1O60635 241 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 F2P00734 622 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TNNC2P02585 160 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CFHP08603 1231 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 HADHBP55084 474 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 BEX3Q00994 111 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TRPC3Q13507 836 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 IRF5Q13568 498 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 HIC1Q14526 733 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 MFSD10Q14728 455 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 KIZQ2M2Z5 673 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 UBR7Q8N806 425 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 PBKQ96KB5 322 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 APBA2Q99767 749 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 LRRC1Q9BTT6 524 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ARFGAP3Q9NP61 516 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CNTN6Q9UQ52 1028 aa19.16■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CES2O00748 559 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CEP104O60308 925 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 IL18RAPO95256 599 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CYP1A2P05177 515 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 MYL3P08590 195 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ZNF653Q96CK0 615 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS10Q9H324 1103 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CDHR5Q9HBB8 845 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 ZMYND10O75800 440 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 IGHA2P01877 340 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 NFICP08651 508 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 UNGP13051 313 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 SREBF2Q12772 1141 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 WDR93Q6P2C0 686 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 RUFY4Q6ZNE9 571 aa19.15■□□□□ 0.66
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF677Q86XU0 584 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CPA5Q8WXQ8 436 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 CCDC102AQ96A19 550 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 HINFPQ9BQA5 517 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-201ENST00000331789 GINS2Q9Y248 185 aa19.15■□□□□ 0.66
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ACTB-201ENST00000331789 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 ERLIN2O94905 339 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 PSEN2P49810 448 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 LONRF2Q1L5Z9 754 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 JADE1Q6IE81 842 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 HDAC7Q8WUI4 952 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 SELENOOQ9BVL4 669 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 NUP85Q9BW27 656 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 ALG6Q9Y672 507 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 NRCAMQ92823 1304 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D8O95759 1140 aa19.13■□□□□ 0.65
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