RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 APBA2Q99767 749 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB6Q9NP58 842 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.41■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALT4O60513 344 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 VSNL1P62760 191 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM270Q6UE05 265 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 STAG3L1P0CL83 205 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 FGFR4P22455 802 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 ITIH3Q06033 890 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SREBF2Q12772 1141 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 KIZQ2M2Z5 673 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 RNF14Q9UBS8 474 aa24.4■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN1O60635 241 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 MCF2P10911 925 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 BEX3Q00994 111 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC102AQ96A19 550 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 GINS2Q9Y248 185 aa24.39■■□□□ 1.5
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC151A5D8V7 595 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TRPC3Q13507 836 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HIC1Q14526 733 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 BRD3Q15059 726 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 AMFRQ9UKV5 643 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 NRCAMQ92823 1304 aa24.39■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 IGHA2P01877 340 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 BPIFB4P59827 614 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MFSD10Q14728 455 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF410Q86VK4 478 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 HES6Q96HZ4 224 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 LACTBL1A8MY62 500 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ERLIN2O94905 339 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 TNNC2P02585 160 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 NFICP08651 508 aa24.37■■□□□ 1.49
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VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL1Q15170 157 aa24.37■■□□□ 1.49
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VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 IL18RAPO95256 599 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CFHP08603 1231 aa24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF653Q96CK0 615 aa24.37■■□□□ 1.49
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VSTM4-201ENST00000298454 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CES2O00748 559 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MYL3P08590 195 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 GNA15P30679 374 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CPT1AP50416 773 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 UBR7Q8N806 425 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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VSTM4-201ENST00000298454 PSEN2P49810 448 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 WDR93Q6P2C0 686 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 PBKQ96KB5 322 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 NIF3L1Q9GZT8 377 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.36■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GUA9 196 aa24.35■■□□□ 1.49
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VSTM4-201ENST00000298454 GPR32O75388 356 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CYP1A2P05177 515 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CD58P19256 250 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF699Q32M78 642 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 JADE1Q6IE81 842 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 CENPFP49454 3210 aa24.35■■□□□ 1.49
VSTM4-201ENST00000298454 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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