RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 NCKAP1LP55160 1127 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 COPS2P61201 443 aa9.39□□□□□ -0.91
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HERC3-201ENST00000264345 TCEAL1Q15170 157 aa9.39□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
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HERC3-201ENST00000264345 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 MDM1Q8TC05 714 aa9.37□□□□□ -0.91
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HERC3-201ENST00000264345 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-201ENST00000264345 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.37□□□□□ -0.91
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