RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 PICK1Q9NRD5 415 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 STK32BQ9NY57 414 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CFAP157Q5JU67 520 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ECSITQ9BQ95 431 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SCN7AQ01118 1682 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FSCN2O14926 492 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CAV1Q03135 178 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 NSMFQ6X4W1 530 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 STKLD1Q8NE28 680 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 NAT14Q8WUY8 206 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 EYA3Q99504 573 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PFDN1O60925 122 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 GAS8O95995 478 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PIK3CAP42336 1068 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SPATA24Q86W54 205 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 NUP85Q9BW27 656 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.53■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SERPINB3P29508 390 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 NR1H3Q13133 447 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 OLFM3Q96PB7 478 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FNBP1Q96RU3 617 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PPM1 405 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 SFI1A8K8P3 1242 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MAGEA4P43358 317 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 COG2Q14746 738 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 TCEAL1Q15170 157 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 CEP95Q96GE4 821 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 FAM161BQ96MY7 647 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.52■■□□□ 1.2
ODC1-201ENST00000234111 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ASLP04424 464 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ZNF398Q8TD17 642 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MORC4Q8TE76 937 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ANPEPP15144 967 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 VAV1P15498 845 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 PGM1P36871 562 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 CPA2P48052 419 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 CDC16Q13042 620 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 CYTH2Q99418 400 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 TYROBPO43914 113 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 USP1O94782 785 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SMARCA1P28370 1054 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 GRIA2P42262 883 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SLC18A1P54219 525 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MYL7Q01449 175 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB16Q05516 673 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 DBN1Q16643 649 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 TTC7BQ86TV6 843 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SLC5A5Q92911 643 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 A8MXQ7 604 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 OPHN1O60890 802 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ZBED4O75132 1171 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 NTSR2O95665 410 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ITGA2BP08514 1039 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 DESP17661 470 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ADRA1DP25100 572 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 TTC1Q99614 292 aa22.5■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 MIS12Q9H081 205 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms