RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 PTENP60484 403 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RTN1Q16799 776 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF197O14709 1029 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 LRG1P02750 347 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PSMC5P62195 406 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 NAB2Q15742 525 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PTGESO14684 152 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CHADO15335 359 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RFC5P40937 340 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf50Q9HD87 102 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PARP2Q9UGN5 583 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PPME1Q9Y570 386 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP46Q8IYW2 2715 aa18.22■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ASAP2O43150 1006 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 NPTXRO95502 500 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CAVIN2O95810 425 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ROR1Q01973 937 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 EMC2Q15006 297 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PON2Q15165 354 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB124Q8NES8 71 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CEP170P1Q96L14 293 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRDP23468 1912 aa18.21■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT5O43286 388 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ABLIM3O94929 683 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CREB5Q02930 508 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 Q4G0T1 1027 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 TCP11Q8WWU5 503 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.2■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 PRRG1O14668 218 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 SLC27A2O14975 620 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CDC27P30260 824 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 USP11P51784 963 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 EPHA5P54756 1037 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM32Q8TC27 787 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 E2F7Q96AV8 911 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.19■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GUA9 196 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 FAM221BA6H8Z2 402 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 EML1O00423 815 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB43O43298 467 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 SEC24AO95486 1093 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 GJA1P17302 382 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 GNA11P29992 359 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CLCN6P51797 869 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 FGD1P98174 961 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 POU5F1BQ06416 359 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ELF2Q15723 593 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4A22Q5TCH4 519 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.18■□□□□ 0.5
SPCS1-201ENST00000233025 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms