RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 EXD1Q8NHP7 514 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LAMB2P55268 1798 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GMNCA6NCL1 334 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NMT2O60551 498 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KCNQ4P56696 695 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GNGT1P63211 74 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CDR2Q01850 454 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GABPAQ06546 454 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RAPH1Q70E73 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DMTNQ08495 405 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 PYGBP11216 843 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CYP2C9P11712 490 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRC41Q15345 812 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DSG3P32926 999 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DERAQ9Y315 318 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PIK3R2O00459 728 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RARBP10826 455 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ARHGDIAP52565 204 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCZ1BP86790 482 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NUP85Q9BW27 656 aa6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MOCS3O95396 460 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 PKN1Q16512 942 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MICALL2Q8IY33 904 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NRBF2Q96F24 287 aa6.69□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SNHG28P0DPA3 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OXER1Q8TDS5 423 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PXMP2Q9NR77 195 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 POLLQ9UGP5 575 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 STAG3L1P0CL83 205 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NCOA4Q13772 614 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TERF2Q15554 542 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ERP44Q9BS26 406 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRD1A4D1F6 860 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MYMKA6NI61 221 aa6.68□□□□□ -1.34
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SETX-201ENST00000224140 ANKRD7Q92527 254 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CYLDQ9NQC7 956 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BAG5Q9UL15 447 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PRKCBP05771 671 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TNFRSF8P28908 595 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ROR1Q01973 937 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KAZNQ674X7 775 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LZTR1Q8N653 840 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.68□□□□□ -1.34
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